第二轮赛程开始后，守护数码兽存活但岛屿上完全体总数低于十个、守护数码兽被击败而且岛屿上完全体总数低于十五个，这两类岛屿的选召者将会失去进入第二轮岛屿之争的资格，他们可以选择前往新大陆或者留下来报复那些他们讨厌的岛屿。选择报复的选召者仅可以使用一只数码兽，失败以后只能前往新大陆。

剩余的岛屿将会被随机打乱位置，正式进入第二轮岛屿之争，第二轮除了守护数码兽外将添加一名选召者领袖。当选召者领袖和守护数码兽都被打倒后，该岛屿选召者将无法再获得奖励，但仍然可以给其他选召者捣乱。

选召者领袖可以由各个岛屿的选召者们共同投票选出，不过选召者领袖只有在同伴们击败二十座岛屿上的守护数码兽或者岛屿领袖后才可以离开岛屿，在此之前只能留在岛屿上抵抗来自其他岛屿选召者的攻击。

第二轮岛屿之争被击败的选召者领袖将会失去领袖资格，同时被击败的选召者将会被随机传送到任何一座参赛的岛屿，随机恢复一只数码兽的状态，方便选召者防身。

这个阶段每击败一只完全体数码兽可以获得十积分，淘汰选择报复的选召者也可以获得十积分，击败参赛选召者可以获得二十积分，击败守护数码兽或者选召者领袖可以获得五十积分，积分可以从商店中兑换奖励。

当最后只剩下一百个岛屿的守护数码兽或选召者领袖未被击败时，岛屿之争将进入到最后一个阶段。

大家一致觉得齐百思应该当这个选召者领袖，必要的时候他甚至可以自己冲上去和其他数码兽硬碰硬。更别提齐百思还有不少数码兽在外，要凑够这二十个守护数码兽或者选召者领袖很容易，这个限制形同虚设。

王者巨龙兽还让它好好躲着就行，反正它在腔棘鱼兽遗迹的核心区域教导突击龙兽和巨龙兽，开心地不亦乐乎。

闲来无事，冯玲继续去摆摊开店，顺便带走了齐百思的后勤组。

在完成击败外来数码兽的隐藏任务数后，齐百思又获得了一只成长期的鲜虾汉堡兽和一只成熟期的汉堡兽，直接凑够了汉堡兽的一家四口。

至于击败完全体数码兽的隐藏任务数，有很多人都可以达到，导致小蛋糕兽的数量暴增，好在有婚礼蛋糕兽在，才没让这群小蛋糕兽抢了冯玲的生意，它们也只能当当服务员或者纪念品。