在给莎莉娜受伤的膝盖作了包扎后，他鼓励莎莉娜不要放弃并将她牵起，然后领着莎莉娜走出了丛林。另外，小智和他的朋友小茂在旅行前就已是一对冤家。有一天小智和小茂垂钓时，两个人从河中钓起了同一个精灵球。两人对这份战利品的归属权产生了争论，最终决定将精灵球切成两半，两人各自持有一半。从这时起，小茂就和小智成了劲敌。后来小智带着这个废弃精灵球，象征着两人的竞争。

十岁时踏上了宝可梦训练家的修行。由于迟到，三只宝可梦都被别人挑走了，小智只好在大木研究所领取了皮卡丘作为第一只宝可梦，并和皮卡丘建立了牢不可破的友情。小智坚定地朝着成为宝可梦大师的目标前行。

小智游历关都地区，遭遇了诸多挑战，不断收服新的宝可梦。小智遇到了包括小刚、小霞在内的许多同伴。与小霞和小刚一起的旅程中，小智仍有许多需要学习。小智完全不了解宝可梦对战，全然通过与宝可梦们成为朋友进而捕获宝可梦们。小智收获的徽章中有许多是由于馆主对小智的感激而赠与的。小智不断磨砺自身作为宝可梦训练家的战斗技巧，并且在石英大会晋级16强。

后来小智重新鼓舞斗志，挑战橘子联盟，在途中遇到了小建，并最终战胜了首席训练家，成为了名誉训练家。

小智其后与小刚和小霞旅行来到城都地区。在城都联盟最终晋级八强。 小智在其后同小刚，小遥和小胜一起游历丰缘地区。并在彩幽大会 晋级八强。

经历了诸多战斗洗礼的小智，意志越发坚定，并决定回到故乡关都地区的对战开拓区进行磨练。

最终成功称霸对战开拓区，并有资格成为开拓之脑的一员。但小智想更多地了解宝可梦和变强，所以小智决定放弃开拓之脑一职，继续作为宝可梦训练家踏上旅程。但是小智依旧有成为开拓之脑的特权。

小智来到神奥地区，小智与小光和小刚结伴同行。并在铃兰大会晋级前四强。尽管失利，小智仍是大会中让达克多拿出第二只宝可梦的训练家。

小智在合众地区继续他的修行。小智同艾莉丝 和天桐 一起旅行。参加了桧垣大会晋级八强。 小智再度启程前往卡洛斯地区，和希特隆、柚丽嘉和儿时的旧识莎莉娜踏上新的旅程。小智参加了密阿雷大会并获得亚军。

小智在阿罗拉地区体验校园生活，与莉莉艾、卡奇、玛奥、水莲、马玛内一起学习，居住在库库伊博士的家中。完成了全部诸岛巡礼并参加了玛纳罗大会首次获得联盟冠军，亦是阿罗拉联盟初代冠军。后在特别表演赛上打败了皇家巨蛋的王者皇家蒙面人-库库伊博士。 小智作为樱木研究所的调查研究员，看了渡和丹帝的比赛后决定参加宝可梦世界锦标赛。最终过关斩将，取得冠军。 在宝可梦！很高兴与你相遇！至小智与小豪！踏上新的旅途!!

中，小智和小豪、小春来到以前小春和樱木所长一起来的森林里露营，但是由于误解，小智和小豪之间的友情遇到了一些问题。

在小春的开导下，小智最后和小豪解除了误会。洛奇亚出现后，小智和小豪向洛奇亚发出了团体战，小智的皮卡丘、路卡利欧，以及小豪的敲音猴、闪焰王牌和千面避役，一起挑战洛奇亚。尽管大家配合默契，无奈洛奇亚实力太过强大，之后小豪试图收服洛奇亚，但是没能成功，大家反而差点被洛奇亚的气旋攻击吹下悬崖，最后被洛奇亚所救，战斗中断。不久后，小智卸任樱木研究所特别调查员身份，和小豪、小春道别，之后和皮卡丘一起踏上了新的旅程，期间与巴大蝶重逢，以及派出路卡利欧和路人训练家的拉普拉斯对战。

小主，

之后在启程之风！无尽的道路!!至小智与拉帝欧斯！，小智和皮卡丘在旅途中又经历了不少事情：在森林中救下受伤的拉帝亚斯；和以前的伙伴小霞争夺铁臂枪虾；和天桐一起将小刚从布莉姆温施放的幻象中解救出来并化解了误会；和杰尼龟消防队一起扑灭了仓库街的大火，救出被困的宝可梦；和拉普拉斯等宝可梦一起救出被卡在洞穴中的吼吼鲸；帮助诅咒娃娃找回它曾经的训练家；摧毁火箭队三人组全员集结捕捉皮卡丘的计划；帮助拉帝亚斯救出拉帝欧斯，打败宝可梦猎人。