宫外的喊杀声吓坏了后宫嫔妃们，比她们胆子更小的，是把守午门的将领策凌，他早已闻讯逃之夭夭。

孝和睿皇后钮祜禄氏还算比较镇定，她派人找来了正在上书房读书的皇子皇孙们。然而皇子皇孙们也已吓得六神无主，只有已过而立之年的皇次子爱新觉罗·旻宁勇敢地站了出来。

他先是命令太监们取来鸟枪和腰刀，亲自出手举起鸟枪，瞄准攀上紫禁城的天理教徒，连续两枪打死两人，镇住了场面。随后他连发五道命令：一是火速奏报嘉靖帝，二是火速关闭紫禁城四座城门并令各路官军入宫捕贼，三是安抚皇母孝和睿皇后并派皇弟贴身保护她，四是亲率兵丁到西长街一带巡查，五是派侍卫到东长街警备。

在旻宁的带领下，一千多名装备精良的清军激战到傍晚，终于打败天理教众，并在此后四天后捕杀七百余人。为响应这次京城起义，直、鲁、豫三省天理会教徒相继起事，结果很快被镇压。

嘉庆帝收到消息后，当即下令封旻宁为智亲王，岁俸增加白银一万二千两，并为他使用的那支鸟枪起名“威烈”。

嘉庆帝对这起恶性事件进行了详细调查，真相令人瞠目结舌。

首先，给天理教众提供机密消息的，竟然是皇帝的近臣宦官。

不仅皇宫似无秘密可言，天理教起义的本身也不是秘密。他们起义的计划早已被知情人获悉并举报，甚至就连他们攻打皇宫的路线、时间也都说得清清楚楚。

但满清宗室、豫亲王爱新觉罗·裕丰收到举报后，竟然毫无警觉之心，他说急什么？等皇帝回来再说吧！

什么都不是秘密，唯有嘉庆帝和他的妻子们什么都不知道。这简直比明朝的梃击案还荒唐。

他无话可说，只能下诏罪己，谓“汉唐宋明未有之变竟发生在如今大清朝”云云。

天理教起义被镇压了，但已无法掩盖清政府官吏懒政、军纪涣散的现实。